Yeni sinir ağı, bir proteinin 3D şeklini 10 dakikada tahmin ediyor

 Yeni sinir ağı, bir proteinin 3D şeklini 10 dakikada tahmin ediyor


Yeni çalışmada, DeepMind kurucu ortağı David Silver, ekibiyle birlikte, protein moleküllerinin şeklini belirlemek için bir sinir ağı eğitti.

İlgili İçerikler:

Yeni çalışmada, yazarlar, belirli bir protein molekülünün onu oluşturan amino asit dizisiyle hangi formu alacağını belirleyen bir sinir ağı oluşturdular. Bu, ilaçların yaratılmasına yardımcı olacaktır.

Şimdi bir proteinin şekli, protein moleküllerinin üç boyutlu fotoğraflarını veren bir parçacık hızlandırıcı kullanılarak veya yapılarını kimya ve kuantum fiziği yasalarına göre hesaplayan bir süper bilgisayar kullanılarak hesaplanır.

Yazarlar, protein moleküllerinin ayrı ayrı bölümlerinin yapısını belirlemeye çalışan ve onları üç boyutlu bir grafik ağacı şeklinde temsil eden bir evoformer algoritması yarattılar – birbirine çiftler halinde bağlanmış bir dizi nesneden oluşan matematiksel bir soyutlama. . Evoformer, zaten bilinen örneklere dayanarak bunları birbirine bağlar ve optimuma yaklaşarak bağlantıların yapısını ve düğümlerin konumunu kademeli olarak değiştirir.

Daha sonra bu tür algoritmaları birleştirip AlphaFold2 sinir ağını oluşturdular.

Geçen yıl, CASP13 yarışmasında proteinlerin yapısını atomik hassasiyetle tahmin edebilen sistemimizin ilk versiyonunu, AlphaFold’u zaten sunmuştuk. Şimdi, hız ve doğruluk açısından tüm rakiplerinden belirgin şekilde üstün olan yeni bir versiyonunu yarattık. Üstelik kaynak kodu tamamen açık.

Deepmind CEO’su Demis Hassabis

Sonuç olarak, sinir ağı, protein içindeki her atom için 0.096 nanometrelik bir hatayla yaklaşık 10 dakika içinde atomik hassasiyetle üç boyutlu şekli yeniden yapılandırır.

Bir yazım hatası bulduysanız, lütfen o metni seçip tuşuna basarak bize bildirin. Ctrl+Enter.

Bu haber İngilizce dilinden Türkçe diline bilgisayar marifeti ile çevrilmiştir. Olası anlam bozukluklarında bu Kaynak adresidnen ingilizce metine ulaşabilirsiniz.

Yapılan Yorumlar

Bir Cevap Yazın