Araştırmadan çıkarılan koronavirüs gen dizileri keşfedildi

 Araştırmadan çıkarılan koronavirüs gen dizileri keşfedildi


Amerikalı bilim adamı, Wuhan’daki en eski COVID-19 vakalarından bazılarının 13 kısmi genetik dizisini ortaya çıkaran Google Cloud’dan silinmiş dosyalar keşfetti. The New York Times tarafından bildirildi.

İlgili İçerikler:

Yeni tip koronavirüs, bugüne kadar dünya genelinde 3,9 milyon ölüme neden oldu. Pandeminin başlangıcında, SARS-CoV-2’nin kökenlerine ilişkin soruşturmalar, vakaların ilk ortaya çıktığı Çin’den gelen bilgilere erişim eksikliği nedeniyle sekteye uğradı.

Şimdi, Seattle merkezli bir araştırmacı, Wuhan’daki en eski COVID-19 vakalarından bazılarından 13 kısmi genetik diziyi ortaya çıkaran Google Cloud’dan silinmiş dosyalar keşfetti.

Diziler, ölçekleri SARS-CoV-2’nin nasıl ortaya çıktığına veya ondan kaynaklandığına dair birçok teoriden birine yöneltmiyor. Örneğin, Wuhan’daki yüksek güvenlikli bir laboratuvardan sızan bir virüs teorisini desteklemiyorlar. Yine de veriler, yeni koronavirüsün Çin eyaletindeki bir deniz ürünleri pazarındaki ilk büyük salgın tespit edilmeden önce bile dolaşımda olduğunu gösteriyor.

Virüsün tam olarak nasıl ve nerede ortaya çıktığını belirlemek için bilim adamlarının diğer tüm suşların türetildiği sözde öncü virüsü bulmaları gerekiyor. Şimdiye kadar, en erken sekanslar çoğunlukla Wuhan’daki Huanan Deniz Ürünleri Pazarındaki vakalardan alındı. Başlangıçta SARS-CoV-2’nin ilk olarak 2019 Aralık ayının sonlarında ortaya çıktığı tahmin ediliyordu. Ancak, o yılın Aralık ayının başından Kasım ayına kadar olan vakaların pazar bağlantısı yoktu. Bu, virüsün farklı bir yerden kaynaklandığını gösterir.

Piyasada bulunan vakalar, haftalar sonra piyasa dışında tespit edilen virüs örneklerinde bulunmayan üç mutasyonu içeriyor. Mutasyonsuz virüsler, at nalı yarasalarda bulunan koronavirüslerle daha yakından eşleşti. Bilim adamları, yeni koronavirüsün bir şekilde yarasalardan kaynaklandığından eminler, bu nedenle atada da bu mutasyonların olmadığını varsaymak mantıklı.

Ve şimdi Seattle’daki Howard Hughes Tıp Enstitüsü’nden Jesse Bloom, silinen dizi verilerinin (muhtemelen bazıları virüsün en eski örneklerinden alınan) de bu mutasyonlardan yoksun olduğunu buldu.

Yaklaşık bir yıl önce, Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH) tarafından sağlanan çevrimiçi bir veritabanı olan Dizi Okuma Arşivi’nden koronavirüs hastalarına ait 241 genetik dizilim kayboldu.

Bloom, Mayıs 2020’de PeerJ dergisinde yayınlanan bir çalışmada bir elektronik tabloya rastladığında eksik dizileri fark etti. Bunlar, Wuhan Üniversitesi projesi PRJNA612766’nın bir parçasıydı ve sözde arşive yüklenmişlerdi. Bilim adamı diziler için arşiv veritabanını aradı ve “Öğeler bulunamadı” mesajını aldı.

Soruşturması, silinen dizilerin Wuhan Üniversite Hastanesi tarafından toplandığını ortaya çıkardı. Bununla birlikte, bu dizilere dayalı olarak yayınlanan bir çalışmanın ön baskısı, bunların salgının başlangıcında COVID-19 şüphesi olan ayaktan hastalardan alınan burun sürüntü örneklerinden alındığını gösteriyor.

Bloom, dizilerin neden kaldırıldığına dair herhangi bir açıklama bulamadı ve çalışma yazarlarına gönderdiği e-postalara cevap verilmedi.

Bilim adamı, “verileri silmek için ikna edici bilimsel bir neden olmadığını” belirtiyor. Gerçek şu ki, diziler eserde açıklanan örneklere tamamen karşılık geliyor. Belgede düzeltme yok. Ek olarak, çalışma, numunelerin gönüllü olarak insanlardan alındığını ve sıralamanın, numunelerde plazmit kontaminasyonu veya kontaminasyonuna dair hiçbir kanıt göstermediğini vurgulamaktadır. Bloom, “Dizilerin varlıklarını gizlemek için kaldırılmış olması muhtemel görünüyor,” diye bitiriyor.

Bulgularını içeren bir makale biorxiv önbaskı sitesinde yayınlandı.

Bir yazım hatası bulduysanız, lütfen o metni seçip tuşuna basarak bize bildirin. Ctrl+Enter.

Bu haber İngilizce dilinden Türkçe diline bilgisayar marifeti ile çevrilmiştir. Olası anlam bozukluklarında bu Kaynak adresidnen ingilizce metine ulaşabilirsiniz.

Yapılan Yorumlar

Bir Cevap Yazın